这篇文章主要为大家展示了“circ2Traits数据库有什么用”,内容简而易懂,条理清晰,希望能够帮助大家解决疑惑,下面让小编带领大家一起研究并学习一下“circ2Traits数据库有什么用”这篇文章吧。miRNA的研究起步很早,miRNA
这篇文章主要为大家展示了“circ2Traits数据库有什么用”,内容简而易懂,条理清晰,希望能够帮助大家解决疑惑,下面让小编带领大家一起研究并学习一下“circ2Traits数据库有什么用”这篇文章吧。
miRNA的研究起步很早,miRNA与疾病相关的文献和数据库也相对成熟,而circRNA作为最近兴起的一种RNA, 可以作为miRNA sponger与miRNA结合, 发挥转录后调控功能。
circ2Traits是一个环状RNA相关的疾病或者特殊性状的数据库,通过分析环状RNA与那些疾病相关的miRNA的相互作用,从而在环状RNA和疾病之间建立起关联。同时为了进一步分析环状RNA在疾病中的调控路径,还构建了circRNA的ceRNA调控网络。该数据库的网址如下
Http://gyanxet-beta.com/circdb/
数据库的构建需要依赖以下4种信息,对应的来源描述如下
从miR2disease数据库得到疾病相关的miRNA信息
从Memzcak等人的研究中得到环状RNA与miRNA的相互作用关系
从starBase数据库得到miRNA-mRNA的相互作用信息
从miRCode数据库得到miRNA和lncRNA的相互作用信息
目前官网只提供了数据下载的功能,示意如下
第一个文件是ceRNA调控网络信息,内容示意如下,第一类为miRNA,第二列为protein coding或者lncRNA转录本,第三列为环状RNA,第四列为疾病的名称
第二个文件是环状RNA的所有信息,包含了circRNA-miRNA和circRNA和miRNA结合区域的SNP信息,内容列数很多,截取如下
通过该数据库,可以得到疾病相关的环状RNA信息,同时其分析疾病相关的环状RNA的思路和将circRNA,ceRNA,SNP信息整合的策略都值得借鉴。
以上是“circ2Traits数据库有什么用”这篇文章的所有内容,感谢各位的阅读!相信大家都有了一定的了解,希望分享的内容对大家有所帮助,如果还想学习更多知识,欢迎关注编程网精选频道!
--结束END--
本文标题: circ2Traits数据库有什么用
本文链接: https://lsjlt.com/news/295224.html(转载时请注明来源链接)
有问题或投稿请发送至: 邮箱/279061341@qq.com QQ/279061341
2024-05-24
2024-05-24
2024-05-24
2024-05-24
2024-05-24
2024-05-24
2024-05-24
2024-05-24
2024-05-24
2024-05-24
回答
回答
回答
回答
回答
回答
回答
回答
回答
回答
0